Francesco Bagnaia va fer una doble remuntada en la cursa del gran premi d’Indonèsia, ja que sortint des de la tretzena posició va aconseguir la victòria, i això, conjuntament amb la caiguda de Jorge Martín, li va permetre remuntar els 7 punts de desavantatge que tenia respecte al madrileny, a qui ara supera per 18 en la general del mundial de MotoGP. L’italià, l’actual campió mundial, va trencar la dinàmica negativa i va tornar al més alt del podi, un lloc que no ocupava des del mes d’agost en el GP d’Àustria. Maverick Viñales va ser segon per tercer cop aquest any.

Jorge Martín, que s’estrenava com a líder de la màxima categoria després de guanyar la cursa a l’esprint de dissabte, va fer una gran sortida i es va situar al davant seguit de Maverick Viñales. Francesco Bagnaia va remuntar des de la tretzena plaça de la graella i en cinc voltes ja estava lluitant per les places de podi. A quinze voltes del final –la cursa era a 27–, Jorge Martín va anar per terra quan era líder de manera clara. Francesco Bagnaia, que anava tercer, va decidir atacar Maverick Viñales, que havia heretat el primer lloc, el va superar a vuit voltes del final, i va gestionar bé l’avantatge. El rosinc va començar a tenir problemes de pneumàtics i es va haver de defensar dels atacs de Fabio Quartararo, que es va situar tercer. Tot i això, Viñales es va anar apropant a Francesco Bagnaia i en la darrera volta va intentar lluitar pel triomf, però es va quedar en el segon lloc a tres dècimes de l’italià, mentre que el francès va ser tercer a quatre dècimes.

Àlex Rins, que tornava a disputar una cursa de gran premi després de la seva lesió, va tenir una bona actuació i va acabar novè, just davant d’Aleix Espargaró, que en les primeres voltes va estar en el grup dels primers i després va anar cedint terreny fins acabar en el desè lloc. Pol Espargaró va caure en la segona volta i Marc Márquez va anar per terra en la setena.