Marc Márquez (Honda) va tor­nar a donar una gran lliçó de pilo­tatge als seus rivals en la clas­si­fi­cació del GP de la República Txeca i va acon­se­guir la posició pre­fe­rent amb dos segons i mig d’avan­tatge sobre el segon clas­si­fi­cat. El cer­verí va arris­car molt en els dar­rers cinc minuts de la Q2, ja que va sor­tir amb pneumàtics de sec quan la pista encara tenia mol­tes zones molles, només hi havia un petit car­ril sec, i a sobre va tor­nar a ploure quan estava fent les seves vol­tes ràpides.

Davant la incre­du­li­tat del seu propi equip, Marc Márquez va fer el millor temps de 2:04.165 en la pri­mera volta, va millo­rar en més de dos segons el temps que el situ­ava en la vui­tena posició pro­vi­si­o­nal i va superar per més d’un segon el francès Johann Zarco (KTM), que ocu­pava al pri­mer lloc. Com que l’aus­tralià Jack Millor (Ducati) també anava ràpid amb pneumàtics de sec i va fer el segon millor regis­tre (2:05.277), Marc Márquez va fer una segona volta al màxim. Tot i que encara plo­via més, va millo­rar el seu temps amb un espec­ta­cu­lar 2:02.753, i va superar per més de dos segon i mig Jack Miller. L’aus­tralià va bus­car una segona volta ràpida per inten­tar situar-se pri­mer però va caure, sense con­seqüències.

Marc Márquez va acon­se­guir la posició pre­fe­rent número 86 de la seva car­rera espor­tiva, i la 58a de la cate­go­ria reina. D’aquesta manera va igua­lar el rècord abso­lut que tenia l’aus­tralià Mick Doo­han en la màxima cate­go­ria.

Pol Espar­garó (KTM) va fer uns grans entre­na­ments al cir­cuit de Brno, va superar la Q1 i en la Q2 va acon­se­guir una meritòria cin­quena posició amb 2:05.710. Àlex Rins (Suzuki) va ocu­par la sisena plaça amb 2:06.172, men­tre que Mave­rick Viñales (Yamaha) va ser novè (2:06.626). No van poder superar la Q1 Aleix Espar­garó (Apri­lia) que va fer 2:06.284 i Tito Rabat (Ducati) que va aca­bar amb 2:07.315.