L’italià Francesco Bagnaia (SKY Racing Team VR46), líder del mundial, sortirà la propera matinada des de la pole position del circuit de Motegi, on pot fer un gran pas per assolir el títol. El francès Fabio Quartararo (MB Conveyors - Speed Up) i el valencià Iker Lecuona (Swiss Innovative Investors) completaran la primera fila de la graella, mentre que Àlex Márquez (EG 0,0 Marc VDS), que arrossega una lesió a l’espatlla després de caure en la jornada de divendres, ha fet el sisè millor temps. Xavi Vierge (Dynavolt Intact GP) ha estat setè, mentre que el portuguès Miguel Oliveira (Red Bull KTM Ajo), el gran rival de Bagnaia pel mundial, sortirà des de la novena posició.

Edgar Pons (MB Conveyors - Speed Up) ha estat 22è i Isaac Viñales ( Forward Racing Team), 29è.