Nou anys després, l'Espanyol torna a tenir a tocar una final de copa. El març del 2006, l'equip que dirigia Miguel Ángel Lotina va eliminar el Deportivo de la Corunya en les semifinals i es va classificar per a la final que el 12 d'abril guanyaria al Saragossa al Santiago Bernabéu de Madrid. L'Espanyol havia guanyat 2-1 en el partit d'anada disputat a l'Estadi Lluís Companys i en la tornada, a Riazor, es va saber defensar i amb un empat a zero va certificar la classificació per a la novena final de copa de la seva història. La felicitat de tots els membres del club va ser màxima, mentre preparaven la conquesta del que seria el seu quart títol de copa.