La parella formada per l'alemany Steffen Thum i el francès Rémi Laffont, de l'equip Rose Vaujany, van ser els primers a completar la primera etapa de la Transpyr 2016. Van ser 116 quilòmetres i 2.100 metres de desnivell en què els 400 participants van haver d'esquivar moltes zones de fang que van dificultar molt el pedaleig. Les pluges dels últims dies havien fet que el terreny, sobretot el dels darrers 30 quilòmetres de l'etapa inaugural, quedés molt deteriorat. De la seva banda, Ibon Zugasti va guanyar l'etapa de la modalitat Backroads.

En l'etapa d'avui, els participants recorreran els 117 quilòmetres i 2.700 metres de desnivell que hi ha entre Camprodon i la Seu d'Urgell passant per Ribes de Freser i la Molina.